cv孙晔 Molecular Ecology:华南农业大学孙晔研究员发表物种分化研究论文
近日,国际著名生态学期刊《molecular Ecology》上发表了华南农业大学林学与风景园林学院孙晔研究员题为"Divergence maintained by climatic selection despite recurrent gene flow: a case study of Castanopsis carlesii (Fagaceae)"的学术研究论文。
孙晔研究员为文章通讯作者和第一作者。
基因交流存在条件下的物种分化(divergence with GENE flow)是生物多样性产生的重要方式。基因交流发生的时间对理解物种分化和形成的地理式样有重要意义,如果基因交流是因为隔离分化后的二次接触(secondary contact)而产生的,物种形成实质上是异域形成(allopatric speciation),而非邻域/同域形成(parapatric/sympatric speciation)。
米锥(Castanopsis carlesii)是我国亚热带常绿阔叶林的优势树种,在其整个分布范围内存在两个变种,即分布于我国东南部的原变种(C. carlesii var. carlesii)和分布于我国西南地区的短刺米锥(C.
carlesii var. spinulosa)。而分布于我国中部地区的米锥其形态性状介于这两个变种之间,推测可能是两变种杂交渐渗的结果。孙晔研究员等以米锥为研究材料,利用简化基因组测序(RAD-seq)和叶绿体基因测序并结合物种分布的生态位模型(niche modelling)对不同的进化场景进行了统计检测,揭示了这两个变种是适应当地气候环境条件的不同生态型(ecotype)。
两变种的分化发生于晚中新世(late Miocene)全球气候变冷导致米锥分布范围收缩隔离的背景之下,而中部群体是在全新世中期(mid Holocene)由于米锥两变种的二次接触产生。本研究提供了一个很好的进化案例,尽管有反复的基因交流发生,但气候的选择作用维持了米锥两变种的分化。