李国君山东大学 山东大学博士高端论坛:生物大数据挖掘的数学方法与挑战
山东大学数学学院博士高端论坛举行了一场主题为“生物大数据挖掘的数学方法与挑战”的讲座报告。本次论坛上,李国君教授作了题为“生物大数据挖掘的数学方法与挑战”的学术报告。运筹学以及相关专业教师、各级博士研究生、硕士研究生和泰山学堂的部分本科生参加了本次活动。
山东大学数学学院下设数学和应用数学、信息与计算科学、统计学、信息安全四个系,设基础数学、科学计算与软件、应用数学、系统与运筹学、控制与系统科学、概率论与数理统计、信息安全七个研究所。
李国君教授先后从生物信息学产生的必要性、生物数据挖掘中数学模型的抽象与构建、算法求解和面临的主要挑战这四个方面详细阐述了该领域中目前比较热门的转录组拼接问题及相关计算工具。
首先,李国君教授从转录组测序技术的发展现状出发,讲述了转录组测序的重要性和面临的主要挑战,进而引入转录组拼接这个问题。在阐述的过程中,李老师巧妙地将转录组拼接问题与日常生活中的“碎纸机问题”加以类比,用生动形象的语言向同学们描绘了转录组拼接的背景。
随后,李国君教授,一一列举了目前该领域比较流行的几个软件程序,并简明扼要地介绍了上述软件的运行原理和存在的优缺点。针对当前算法的缺点和不足,李老师依次介绍了他的研究团队在该领域已经完成的主要科研成果,以及运用的数学模型。
其中,李老师指出,图论和组合优化是转录组拼接问题的“主力”。李老师深入浅出地为同学们讲述了转录组拼接问题中蕴含的经典离散数学问题和其中运用的组合算法。
最后,李老师兴致勃勃地向同学们阐述了生物大数据挖掘的巨大发展潜力,并鼓励我们注重学以致用,提倡我们要敏锐地发现交叉学科中所蕴含的数学问题,结合自身的数学背景,运用计算机技术加以解决。此外,对于参加论坛的同学们,李老师耐心地讲解了交叉学科问题与传统数学问题研究方法的区别,提醒大家避免将数学学科中的一些思维方式,不合时宜地应用到生物信息学中。
李国君教授生动形象的语言、深入浅出的案例,赢得了在场观众的阵阵掌声,受到了师生们的一致好评。
本次高端博士论坛活动为促进学术思想和科研成果的交流提供了平台。在李老师的悉心讲解下,我们认识到了数学学科在广大交叉学科领域中应用的广泛性和重要性。本次活动拓宽了同学们的视野,激发了研究生的科研兴趣。另外,对于即将踏入科研领域的本科生,发挥了显著的引导作用。
